首先，公辦高校和民辦高校的辦學主體不同。公辦高校就是國家出資創建的，民辦高校是私人老板設立的。一般來說，公辦高校都是政府出錢建設維持的，屬于國家事業單位序列，學校的管理人員都是國家公職人員。民辦高校的“民辦”二字也就意味著這些高校一般是非政府組織或者個人創建的，這些高校的建設維持資金來自于私人或非政府組織，學校的管理人員不是國家公職人員。

其次，公辦高校和民辦高校的學費不同。這個不同對于學生和學生家長來說，是最簡單的一個區分公辦高校和民辦高校方法。一般除了公辦高校的合作辦學項目，正常招錄的學生學費都是不高的，基本上都在一萬以下。但是民辦高校的學費就沒那么親民了，畢竟民辦高校不是政府出資，沒有財政補貼，所以收費都很貴，一般都是一萬以上。所以考生和考生家長在填報志愿時，如果發現某一所非中外辦學高校學費很貴，那么這所高校大概率就是民辦高校，也就是原來的“三本”院校。

最后，公辦高校和民辦高校的社會認可度不同。民辦高校長時間以來都是在“三本”批次錄取，“三本”批次是我國本科層次高校金字塔的底端，錄取的大多都是考不上一二本的考生，生源質量相對來說比較差，所以在社會上的認可度也相對不是很高。公辦高校在很多人眼中才是正經的大學，這些高校都是在二本線上錄取，所以這些高校自然是考生眼中的香餑餑，錄取分數高，生源質量好，更受用人單位歡迎。

二三本合并對于原來的“三本”民辦高校來說是個機會，意味著可以和原來的“二本”公辦高校同場競技，獲得優質生源，一些名校的獨立學院在二三本合并后大概率分數會有所增加。對于考生來說，還是要認真區分公辦高校和民辦高校的區別，不要出現志愿填報失誤才好。