青海衛生職業技術學院是全省唯一一所衛生類高職院校，其前身是1935年3月青海省衛生實驗處舉辦的第一期種痘人員講班。1939年省政府開辦醫務佐理人員訓練所，設醫佐班和護士班。

1943年，醫務佐理人員訓練所改名為衛生人員訓練所。1948年10月，衛生人員訓練所改名為省立高級護士職業學校，1948年春正式開學，馬步芳兼任校長，學制三年，聘請專業人員任教。1949年9月學校由中國人民解放軍第一軍司令部衛生處接管。1950年學校與青海軍區衛生學校合并為中國人民解放軍第一軍衛校，1951年7月中國人民解放軍第一軍奉命赴朝鮮參加抗美援朝戰爭，遂將該校移交給地方政府，正式建校為青海省中級衛生技術學校。

五十年代學校曾數次更改校名，1951年為青海省中級衛生技術學校，1954年為青海省衛生學校，1955年為青海省西寧衛生學校，1958年為青海省第一衛生學校，1960年第一衛校與第二衛校合并，改名為“青海省衛生學校”，此名沿用至2003年學校升格為青海衛生職業技術學院。1984年，經省政府批準，國家教委備案，在青海省衛生學校的基礎上成立了“青海省衛生干部專科學校”并掛牌招生，承擔省內成人醫學專科教育任務。1990年省內5所職工專科學校合并成立了“青海省聯合職工大學”，學校成為聯合大學的衛生分校，當時三塊牌子，一套領導班子。1993年經省教委評估，被省政府確定為“省部級重點中專學校”。

2001年3月被國家教育部確定為“國家級重點中等職業學校”，2003年正式升格為青海衛生職業技術學院。