濟寧醫學院招生專業共計有27個，分別為病理學與病理生理學、神經病學、免疫學、心血管疾病研究診療中心、神經內科學、預防醫學、臨床醫學、護理學、藥學、醫學檢驗等，具體更多完整招生專業請看下表。

濟寧醫學院招生專業一覽表

濟寧醫學院重點專業名單

國家級專業（2個）：預防醫學、臨床醫學。

省級專業（7個）：預防醫學、臨床醫學、護理學、藥學、醫學檢驗、藥物制劑、精神醫學。

山東省省級教學改革試點專業（1個）：臨床醫學。

山東省重點學科（5個）：病理學與病理生理學、神經病學、免疫學、心血管疾病研究診療中心、神經內科學。