根據2016全國二本大學排名，云南共有18所二本大學參與云南二本大學排名，其中排名第一的是云南師范大學，排名第二的是云南民族大學，排名第三的是云南農業大學，以下是云南二本大學排名列表，供大家參考!(注：括號內為全國排名。)特別說明，某些院校在河南省內是一本招生，但在其它省份是二本招生的，在此也歸為二本院校。

　　1、云南師范大學(173)——師范

　　云南師范大學，坐落在云南省昆明市，是一所由云南省人民政府管理的師范大學，是國家“中西部高校基礎能力建設工程”建設高校，是全國免費師范生試點改革的三個地方高等師范院校之一和首批來華留學示范基地建設高校和卓越教師培養計劃實施高校。

　　2、云南民族大學(197)——民族

　　云南民族大學(Yunnan Minzu University)坐落于春城——昆明，是國家博士學位授予單位、中國首批卓越法律人才教育培養計劃建設高校和國家民委雙語人才培養基地、國家民族事務委員會與云南省人民政府共建的省屬重點大學。

　　3、云南農業大學(222)——農林

　　云南農業大學位于春城昆明，是云南省省屬重點大學，國家首批卓越農林人才教育培養計劃和卓越工程師教育培養計劃改革試點高校。創辦于1938年，前身是國立云南大學農學院，建址昆明市呈貢縣，1958年獨立建成昆明農林學院，遷址昆明北郊黑龍潭，1971年與云南農業勞動大學合并成立云南農業大學，2008年教育部本科教學評估為優秀。

　　4、云南財經大學(262)——財經

　　云南財經大學 ，簡稱“云財”，坐落于中國面向東南亞、南亞、東盟開放的重要樞紐城市——“春城”昆明，是一所以經濟學、管理學為主，法學、哲學、文學、理學、工學、藝術等學科協同發展的省屬重點大學，形成了以本科培養為主，兼有碩士研究生、博士研究生、留學生培養和繼續教育的多層次人才培養體系。

　　5、昆明醫科大學(266)——醫藥

　　昆明醫科大學(Kunming Medical University)，簡稱昆醫大，云南省最大的集教學、醫療、科研為一體的高等醫學院校。中國“中西部高校基礎能力建設工程”重點建設高校之一，“卓越醫生教育培養計劃”試點高校。

　　6、西南林業大學(353)——農林

　　7、大理大學(436)——綜合

　　8、云南中醫學院(479)——醫藥

　　9、楚雄師范學院(536)——師范

　　10、玉溪師范學院(552)——師范

　　11、曲靖師范學院(566)——師范

　　12、紅河學院(620)——綜合

　　13、文山學院(667)——師范

　　14、昆明學院(674)——綜合

　　15、保山學院(691)——師范

　　16、普洱學院(691)——綜合

　　17、滇西科技師范學院(706)——師范

　　18、昭通學院(711)——師范