根據師資隊伍、教學水、科研水、學科聲譽、教師數、博碩士學位點數、科研項目數、杰出人才數、全國性學生競賽獲獎數、國家自然科學基金項目數等多個方面進行排名。

中國最好學科排名采用的學科口徑是教育部最新《學位授予和人才培養學科目錄》中的一級學科。在每個一級學科，排名的對象是在該一級學科設有學術型研究生學位授權點的所有高校，發布的是在該學科排名前50%的高校。軍事學門類下的一級學科由于其特殊性，未被納入排名。公安學、系統科學、科學技術史等設置頻次低、可用指標稀缺的一級學科，也未被納入排名。

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