四川農業大學王牌專業：茶學、草業科學、農林經濟管理、農學、動物醫學、動物科學、林學、農業資源與環境、園林、園藝學。

根據2017年全國第四輪學科評估結果綜合計分，學校在全國農林高校、在川高校中分別位居第7、第4。

從2015年起，農業科學、植物學與動物學2個學科ESI排名持續穩定保持世界前1%。

2017年動物營養與飼養科學、2018年作物學入選全國高等院校學科創新引智計劃（111計劃）。

國家級專業（10個）：茶學、草業科學、農林經濟管理、農學、動物醫學、動物科學、林學、農業資源與環境、園林、園藝學。

國家級重點學科：動物營養與飼料科學、作物遺傳育種

國家重點（培育）學科：動物遺傳育種與繁殖、預防獸醫學

農業部重點學科：作物遺傳育種

林業局重點學科：森林培育

四川省重點學科（一級學科）：作物學、畜牧學、獸醫學

世界一流學科：作物學