新疆高考志愿實行行志愿“分數優先、遵循志愿”。具體地說，行志愿首先按照分數將考生排序，然后按照順序依次檢索新疆考生所填報的志愿，一旦出現符合投檔條件的學校，即向該校投檔，體現“分數優先，遵循志愿”的原則。

一、新疆高考行志愿錄取規則

新疆高考行志愿在正式錄取時，新疆招考部門會先對所有考生的高考成績 (含教育部和省市規定的加分項目的加分分值)分文科和理科排隊。(總分相同時，按文、理科不同的單科順序進行。

文科單科順序依次為語文、外語、數學、綜合；理科依次為數學、外語、語文、綜合)，然后按分數優先的原則進行投檔。

新疆行志愿在實際錄取中，每個批次都按高考成績對考生排序，逐分逐個檢索考生填報的志愿，只要檢索到符合投檔條件的院校，即向該院校投檔。

二、新疆高考志愿批次設置

1、本科一批次：經批準參加本批次錄取的新疆本科高校(專業)。設置一個志愿組9個行志愿，每個志愿可填報6個專業。

2、本科二批次：經批準參加本批次錄取的新疆本科高校(專業)。設置一個志愿組18個行志愿，每個志愿可填報6個專業。

3、新疆高職(專科)批次：本科高校的專科專業、高職(專科)高校。設置一個志愿組9個行志愿，每個志愿可填報6個專業。

三、新疆高考志愿填報順序

新疆高考志愿錄取順序如下：

本科提前批次→國家及地方專項、南疆單列、對口援疆計劃本科一批次→第一次征集志愿→高校專項計劃錄取批次→本科一批次→第二次征集志愿→國家及地方專項、南疆單列、對口援疆計劃本科二批次→本科二批次→三校生升高職批次→第三次征集志愿→高職（專科）提前批次→高職（專科）批次→第四次征集志愿→第五次征集志愿。